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        上海雅吉生物科技有限公司

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        沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR試劑盒說明書

        2019-8-9  閱讀(428)

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        沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR試劑盒

         

        中英文名稱

        規格

        價格

        說明書

        Haplosporidium costale

        沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR試劑盒

        50

        3490

         

        運輸:低溫

        保存:負20

        有效期:一年

        貨期:2-3

        產品及特點

        1. 即開即用,用戶只需要提供沿岸單孢子蟲樣品。

        2. 根據沿岸單孢子蟲探針法熒光定量保守序列設計的專一性引物,與相關病毒無交叉反應。

        3. 靈敏度可以達到幾百拷貝/反應。

        4. 一管式熒光定量PCR檢測,避免后續污染。

        5. 本試劑盒足夠50次20μL反應體系的熒光定量PCR。

        本產品只適用于科研,不能用于臨床診斷。

        規格及成分

        成分

        編號

        十孔盒包裝

        2×qPCR MagicMix

        試劑一

        500μL(棕色管)

        熒光PCR模板稀釋液

        試劑二

        1 mL(黃蓋)

        沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR引物混合物

        試劑三

        100μL(白蓋)

        沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR陽性對照

        (1×10E8 拷貝/μL)

        試劑四

        50μL(紅蓋)

        使用手冊

        試劑五

        1

        運輸及保存

        低溫運輸,-20℃保存,保存期限一年

        自備試劑 

        DNA模板、10×ROX(根據機型決定,具體見使用方法)。

        使用方法

        、稀釋PCR陽性對照(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)

        1. 注意:由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產品穩定性和避免擴散傳染性病原,本產品不提供活體樣品做陽性對照,只提供可以直接使用的DNA片段作為陽性對照。

        2. 標記6個離心管,分別為7,6,5,4,3,2。

        3. 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR模板稀釋液(用帶芯槍頭,下同)。

        4. 在7號管中加入5 μL 1×10E8拷貝/μL 的陽性對照,充分震蕩1分鐘,得1×10E7拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

        5. 換槍頭,在6號管中加入5 μL 1×10E7拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

        6. 換槍頭,在5號管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL的陽性對照到5號管中,充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

        7. 重復上面的操作直到得到6個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。

        二、樣品DNA的制備

        8. 如果有N個樣品,必須設置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是NC(樣品制備陰性對照)。可以用10μL上步制備的PCR陽性對照的第4號(濃度為1×10E4 拷貝/μL,10μL相當于1萬拷貝)或第5號(濃度為1×10E5 拷貝/μL,10μL相當于10萬拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。如果每次制備需要200μL樣品,則PC和NC的體積也必須是200μL。

        9. 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場上大多數病毒DNA提取試劑盒兼容。

        三、設置qPCR反應(20 μL體系,在樣品制備室進行)

        10. 如果只做1次重復,則標記N+9個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照,6個用于PCR陽性對照。如果做2-3次重復,則反應設置數量相應增加2或3倍。

        11. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后加):

        成分

        樣品管

        N+2

        PCR陰性對照管

        PCR陽性

        對照管(2-7管)

        2×qPCR MagicMix

        (棕色管)

        10 μL

        10 μL

        各10 μL

        沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR

        引物混合液(白蓋)

        2 μL

        2 μL

        各2 μL

        自備10×ROX (見注)

        2 μL

        2 μL

        各2 μL

         N+2待測樣品DNA模板

        6 μL

        不加

        不加

        第7步所得PCR陽性對照

        稀釋液(2-7號)

        不加

        不加

        各6μL(2號樣到2號管,3號樣到3號管…)

        注:僅ABI7500、7700和7900儀器需要使用ROX作為對照,其他熒光PCR儀器(如iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000和LightCycler480)不需要使用ROX,則用水替代。

        12. 蓋上蓋子后上機,按下面參數進行PCR(具體PCR參數可以根據儀器不同而自行優化)。

        過程

        溫度

        時間

        預變性

        92℃

        5分鐘

        PCR反應

        (30個循環)

        92℃

        60 

        54℃

        60 

        72℃

        60 

        13. 數據采集

        具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產品中所含的熒光染料在不結合DNA時,大吸收光譜在471 nm,結合DNA時的大吸收光譜在500 nm,大發射光譜在530 nm。信號采集可以設置在復性或延伸步驟。 

        四、數據處理

        14. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,再推算出其濃度。

        如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數增長,有典型擴增曲線,Ct值應該小于或等于30。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復一次。重復實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。

         

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